Comprendre l’évolution des coronavirus : des origines aux sauts d’espèces

Les deux coronavirus du porc les plus connus sont l’alphacoronavirus de la gastroentite transmissible (GETv) et celui de la diarrhée épidémique porcine (PEDv) responsables de pertes économiques importantes.

En 2016, dans la province de Guandong, une nouvelle maladie, appelée SADS pour Swine Acute Diarrhea Syndrome, a été décrite et un alphacoronavirus (SADS-Cov) isolé, présentant de 96 à 98 % d’identité nucléotidique avec les alphacoronavirus de chauve-souris (Rhinolophes) de cette même province. C’est sans doute la première observation documentée d’une transmission à partir de la chauve-souris d’une coronavirose sévère chez l’animal domestique.

En 2014, en Chine et aux USA, une nouvelle maladie du porc, à dominante digestive, a émergé, due à un deltacoronavirus, le PDCov (Porcine delta coronavirus), qui présentait 80 % d’identité nucléotidique avec les deltacoronavirus des moineaux et des cailles.

A travers l’exemple de l’émergence récente chez le porc de ces deux coronavirus apparentés aux coronavirus de chauves-souris ou d’oiseaux, Hubert Laude présente, dans cet article soumis au Bulletin de l’Académie Vétérinaire de France, les passages des coronavirus entre espèces et la complexité des mécanismes moléculaires en jeu, invitant à relativiser le rôle, perçu comme prépondérant aujourd’hui, des chiroptères comme réservoirs.

Référence : Laude H. Deux coronavirus entéropathogènes nouvellement identifiés chez le porc sont apparentés à des virus de chauves-souris ou d’oiseaux. Bulletin de l’Académie Vétérinaire de France, 2020, sous presse.

Voir aussi notre article « Coronavirus humains et animaux : le dossier de l’Académie Vétérinaire de France« .

Source : Académie vétérinaire de France